Jej korzenie sięgają początków ubiegłego stulecia. Wielokrotnie zmieniała lokalizację, by ostatecznie od 1991r. usytuować się w budynku przy ulicy Płockiej 38. Od 16 czerwca 1997r. "Dwójka" nosi imię Armii Krajowej, zaś jej uczniowie opiekują się wzniesionym nieopodal pomnikiem poświęconym "Żołnierzom Września 1939r. i Armii Krajowej". Z końcem 2002 r. skromna dotychczas baza lokalowa szkoły uległa wyraźnej poprawie - została oddana do użytku pełnowymiarowa hala sportowa wraz z nowym segmentem dydaktycznym obejmującym 6 sal lekcyjnych, bibliotekę, kuchnię, stołówkę oraz szatnie. Uczniowie mają możliwość uczestniczenia w zajęciach dodatkowych oraz pozalekcyjnych. Od pierwszej klasy uczą się języka angielskiego lub niemieckiego, mogą rozwijać swoje uzdolnienia poprzez udział w kołach przedmiotowych. W szkole działają dwa zespoły wokalne - "Uśmieszki" i "Wesołe nutki", gromada zuchowa, drużyna harcerska oraz Szkolny Klub Europejski "Brukselka". Od 2006r. "Dwójka" uczestniczy w programie "Sokrates Comenius". W rezultacie reformy systemu edukacji zainicjowanej w 2016r. do Szkoły Podstawowej Nr 2, na podstawie uchwały Rady Miejskiej Sierpca, zostało włączone  Gimnazjum Miejskie im. Mikołaja Kopernika. Tym samym od 1 września 2019r. szkoła mieści się w dwóch obiektach zlokalizowanych odpowiednio przy ul Płockiej 38 oraz ul. Braci Tułodzieckich 2. Dyrektorem szkoły jest pani Anna Trzcińska